[EN VIDÉO] 5 questions sur la variante Delta La variante Delta ou variante B.1.617.2, anciennement appelée variante indienne, inquiète les autorités sanitaires. En quoi est-ce différent ? Doit-on s’inquiéter ?
La variante Deltacron a été identifiée pour la première fois en janvier 2022 à Chypre, où une équipe a affirmé avoir identifié 25 cas. A l’époque, la communauté scientifique avait émis des doutes sur l’existence réelle de cette variante, proposant à la place une contamination des échantillons. Puis, à la mi-février, la UK Health Insurance Agency a également signalé un cas d’infection hybride entre la variante Delta et la variante Omicron. Et il y a probablement eu un cas exceptionnel d’infection d’une personne par les deux variantes en même temps. Au cours de la même période, des cas de grippe et d’infection à coronavirus ont également été signalés. Puis nous avons parlé de Flurona, contraction entre “grippe”, “grippe” et “coronavirus”. Cependant, malgré les doutes sur l’existence réelle de Deltacron, la France a décidé de surveiller de près cet éventuel variant recombinant depuis le 18 février 2022. Elle a confié ces travaux aux laboratoires du consortium Emergen, Santé Publique France et le CNR (Centre National de Référence) pour les virus des infections respiratoires. Depuis, le nom donné au Deltacron est XD.
Que savons-nous du génome variant XD ?
Le variant XD ne résulte ni de l’infection d’échantillons ni de la co-infection avec deux virus de la même cellule. Il s’agit en effet d’une nouvelle variante. Selon le point épidémiologique du Covid-19 en date du 24 mars 2022 par la Santé Publique de France, le génome du variant XD est constitué de :
la majorité du génome de la variante Delta (Soulignement AY.4). du génome du variant Omicron (sous-lignée BA.1) en une partie petite mais stratégique, le gène S codant pour la protéine Spike.
Rappelons que la protéine Spike est une protéine présente à la surface du virus. Il a la capacité de se lier à un récepteur humain, appelé ACE2. Ce récepteur est répandu à la surface des cellules humaines, notamment dans les poumons. Par ce lien, le virus pénètre dans nos cellules.
Que sait-on de la diffusion de la variante XD en France ?
Selon le point épidémiologique du Covid-19 du 24 mars 2022 de la Santé publique de France, 44 cas ont été recensés sur le territoire. Beaucoup de ces infections remontent à janvier 2022, “indiquant la libération de ce recombinant à de faibles niveaux pendant plusieurs semaines”. Pourtant, le nombre de cas détectés semaine par semaine ne semble pas augmenter. À juste titre, cette variante fait peur. Imaginez une variante avec le danger de Delta et la contagion d’Omicron ! Cependant, il n’y a rien à craindre pour le moment. Le rapport indique qu’”à ce jour, très peu de données sont disponibles sur les caractéristiques de la variante XD, mais les recherches sont en cours”.
Que sait-on du premier cas de la variante Deltacron découvert au Royaume-Uni ?
Article de Stéphanie le Guillou publié le 19/02/2022 Le nombre de cas d’infection à Omicron continue de baisser en France : – 44% de nouveaux cas positifs par rapport à la semaine dernière le lundi 14 février. La sortie de crise semble se dessiner… à moins que de nouvelles variantes plus contagieuses ou plus dangereuses n’émergent. Un cas de Deltacron a été détecté au Royaume-Uni à la fin de la semaine dernière. Qu’est-ce que c’est ? Doit-on s’inquiéter ? La variante Deltacron avait déjà été évoquée début janvier. Il s’agirait d’une nouvelle variante du coronavirus, issue d’une recombinaison entre Delta et Omicron. Une équipe chypriote a alors affirmé avoir identifié 25 cas de Deltacron. Par conséquent, de sérieux doutes ont été exprimés quant à l’existence de cette variante. Une contamination des échantillons a été signalée. Ce vendredi 11 février, la variante Deltacron est revenue sur le devant de la scène : le Health and Safety Service britannique a indiqué avoir détecté un premier cas d’infection hybride. Ce variant, baptisé “Delta x Omicron recombinant”, fait désormais partie de la liste des variants “sous surveillance” par les autorités britanniques. Est-ce vraiment une nouvelle variante ?
Un simple cas d’infection ?
Avant de parler d’une nouvelle variante, d’autres explications doivent être éliminées, notamment le cas d’une infection. Sachez qu’une même cellule peut être infectée par deux virus en même temps. Des cas récents de grippe et d’infection par le SRAS-CoV-2 ont été signalés. A cette époque, on a rapidement entendu parler de Flurona, une contraction entre le “grippe” (la grippe) et le coronavirus. Cependant, il ne s’agissait pas d’un nouveau virus ou d’une nouvelle variante, mais d’un patient qui avait été infecté par les deux virus en même temps. Dans le cas de Deltacron détecté au Royaume-Uni, il est très probable que le patient ait été infecté à la fois par la variante Delta et la variante SARS-CoV-2 Omicron.
Plus de risques ?
Quand vous pensez à quel point Delta est dangereux et à quel point Omicron est contagieux, le mot Deltacron est absolument terrifiant ! Les cas de deltacron sont extrêmement rares à l’heure actuelle et le rapport britannique est le seul cas officiellement enregistré. Par conséquent, les données ne sont pas suffisantes pour tirer des conclusions sur ce type d’infection hybride. Or, les populations européennes disposent désormais d’un bon niveau de protection contre les variants Delta et Omicron, d’une part grâce à la vaccination et d’autre part du fait de la forte circulation du variant Omicron ces dernières semaines. Par conséquent, il n’y a aucune raison de s’inquiéter de l’apparition de cette nouvelle variante pour le moment. Même si la variante Deltacron ne semble pas en être une, la menace de nouvelles variantes reste indéniable. Comme le disait il y a quelques semaines le directeur général de l’OMS, le risque de nouvelles variantes plus contagieuses et mortelles est “très réel”.
Deltacron : y a-t-il vraiment une nouvelle variante découverte à Chypre ?
Article de Julie Kern publié le 01/10/22 « Deltakron » est un terme qui a fait le tour des médias ce week-end. Il s’agirait d’une variante du SARS-CoV-2, un mélange entre Delta et Omicron, découvert à Chypre. L’existence réelle de cette nouvelle variante ne fait pas encore l’unanimité. Samedi 8 janvier 2021, l’agence de presse Bloomberg a publié une information qui a rapidement fait le tour des médias. Leontios G. Kostrikis, biochimiste chypriote et chef du laboratoire de biotechnologie et de virologie moléculaire à l’Université de Chypre, a découvert une nouvelle variante du coronavirus, résultant de la recombinaison des variantes Delta et Omicron. Le scientifique a partagé sa découverte, baptisée “Deltakron” sur la chaîne de télévision Sigma lors d’une interview le 7 janvier 2021.
La variante Delta avec des signatures génétiques Omicron
Le génome de Deltacron serait très similaire à celui de la variante Delta, mais aurait des mutations propres à l’Omicron. Leondios Kostrikis et son équipe affirment avoir identifié 25 cas de Deltacron. Les séquences de ce dernier ont été transmises à Gisaid par des scientifiques chypriotes, une base de données qui regroupe les séquences des variants du coronavirus, mais Deltacron ne fait pas encore partie de la liste des variants répertoriés par le site. En effet, la découverte de Deltacron laisse de nombreux scientifiques sceptiques. Tom Peacock, virologue à l’Imperial College de Londres, s’est exprimé sur Twitter. Pour lui, il s’agit d’un problème de contamination des échantillons plutôt que d’un véritable événement de recombinaison.
Une variante qui n’existe pas ?
Leondios Kostrikis a déclaré à Bloomberg le 9 janvier 2021 que les 25 échantillons n’avaient pas été séquencés en même temps, ce qui, selon lui, exclut toute erreur technique. De plus, il ne pense pas que Deltacron soit le résultat d’une recombinaison entre Delta et Omicron chez un patient infecté par les deux variantes en même temps, mais plutôt le résultat de l’évolution naturelle d’une variante plus ancienne. Existe-t-il vraiment une variante Deltacron ? Il est difficile de comprendre seulement à partir de ces choses. Pour confirmer l’existence de Deltacron, d’autres observations similaires doivent être faites de manière répétée et indépendante dans différents laboratoires. Soutenez une équipe éditoriale dédiée à la diffusion de la science chez Patreon ! Notre mission ? Rendre la connaissance accessible au plus grand nombre. Nous produisons quotidiennement nos propres articles, enquêtes et rapports, le tout à taille humaine. Accompagnez-nous dans cette démarche et cette ambition. Abonnez-vous à Futura sur Patreon ! Je soutiens l’indépendance de Futura chez Patreon ! Deux programmes d’abonnement vous sont proposés avec les avantages suivants :
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